L'Université Claude Bernard Lyon 1 est une université multidisciplinaire dont la recherche va de la recherche fondamentale à ses applications comprenant 73 unités de recherche contractualisées en association avec le CNRS, l'INSERM, l'INRA, l'INRETS... et impliquant 3500 personnes.

Des regroupements au sein de Structures Fédératives de Recherche (IFR, SFR, FED, FR) favorisent , par la mise en commun de moyens, par leur pluridisciplinarité, l'émergence de jeunes équipes, le développement de la valorisation et l'amélioration de la formation. L'Université Claude Bernard Lyon 1 apporte également son soutien à des Plates-formes, Plateaux techniques et Collections.

La politique scientifique de l'établissement est définie par le Conseil Scientifique qui a retenu trois priorités scientifiques : santé, environnement, matériaux.

L'Université Claude Bernard Lyon 1 délègue à sa filiale EZUS LYON 1, la charge de la valorisation des activités de recherche.

Témoin de l'internationalisation de l'établissement, la Charte Européenne du Chercheur a été adoptée par l'Université. Les objectifs sont de renforcer l'attractivité et le rayonnement international de l'Université de Lyon par l'accueil et l'échange d'enseignants chercheurs et de chercheurs étrangers.